Los arrestos se produjeron tras un par de balaceras letales que se cree fueron perpetradas por activistas de Hamas.
Unos 70 miembros del grupo fueron detenidos esta semana, 40 de ellos en la operación nocturna, explicó el funcionario, que habló bajo condición de anonimato por temor a ser arrestado.
El ejército de Israel confirmó el viernes las detenciones.
Un pistolero palestino abrió fuego el jueves contra una parada de autobús en Cisjordania matando a dos soldados. Antes esta semana, otro atacante disparó contra una parada causando siete heridos y el parto prematuro de un bebé que falleció más tarde.